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比利時 Diagenode公司Bioruptor Pico核酸打斷儀處理FFPE核酸樣品

來源: | 作者:1 | 發布時間: 2018-05-07 | 70 次瀏覽 | 分享到:

比利時 Diagenode公司Bioruptor Pico核酸打斷儀處理FFPE核酸樣品 

試用日期:2018年3月

試用單位:上海華測艾普醫學檢驗所

試用詳情:

Sample volume: 100 μl

Tubes:美國Axygen 0.6ml低吸附離心管(貨號:MCT-060-L-C)和Qubit  Assay Tubes

Tube holder:  0.65 ml tube holder & tube adaptor for Bioruptor? Pico (Cat. No. B01200010) for 12 x 0.65 ml tubes

DNA concentration:  10 ng/μl

DNA type:FFPE

Sonication buffer: TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA), pH 7.5 - 8.0

Target size:200bp

Sonication cycles: 13 cycles (30 sec ON/OFF)

 

 

 

儀器正在預冷……

 

廠家推薦循環數:

 

樣品超聲后毛細管電泳系統檢測結果:

結果分析:

本次試用主要檢測Bioruptor Pico處理FFPE核酸樣品的性能,同時簡單做一下樣品管的對比實驗。

 

前6個樣品是廠家推薦使用美國Axygen 0.6ml低吸附離心管,后6個隨手使用的是Qubit測試管。

明顯可以看出前6個樣品的打斷效果正常,對于Bioruptor Pico核酸打斷儀,處理FFPE核酸樣品沒有任何壓力。

 

后6個樣品沒有達到目的片段大小,打斷效果不理想。

為什么Qubit測試管為何效果不好

首先該測試管品質好,透光性好,可惜由于測試管比較軟,導致結果不理想。

關于樣品管的選擇在此反復申明一下——選擇樣品管,越薄越硬越好,反之越厚越軟越差,管子干嘣脆,結果好的一片跪。

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