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上海伯豪生物試用Bioruptor Pico核酸剪切儀

來源: | 作者:1 | 發布時間: 2017-06-08 | 77 次瀏覽 | 分享到:

比利時 Diagenode公司Bioruptor Pico核酸剪切儀試用概述

 

Biorupter打斷條件測試-2017.5.18.pdf

試用日期:2017年5月

試用單位:上海伯豪生物

試用詳情:

Sample volume: 100 μl

Tubes: 0.65 ml Bioruptor? Microtubes (Cat. No. C30010013)

Tube holder:  0.65 ml tube holder & tube adaptor for Bioruptor? Pico (Cat. No. B01200010) for 12 x 0.65 ml tubes

DNA concentration:  0.1-10 ng/μl

Sonication buffer: TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA), pH 7.5 - 8.0

Target size:150-1000bp

Sonication cycles: 按照廠家參考循環數

 

 

 儀器已經預冷,陳老師準備樣品……

 

 

 

結果分析:

DNA concentration:  1ng/μl

Target size:150bp

Sonication cycles: 30 cycles (30 sec ON/OFF)

試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。三個樣品由于實際濃度有差別,所以波峰有高低。總體上波峰稍稍拖后。Pico儀器是市面上唯一一款60KHz的超聲波破碎儀,片段極限在70bp。熟悉DNA打斷實驗的都知道,目的片段越小、濃度越高越難處理。之前在新培晶試用時,由于濃度太高(50 ng/μl),導致超聲時間過長,效果一般。鏈接:http://www.xyhrim.buzz/news/html/?89.html

 

 

 

DNA concentration:  紅1 ng/μl和藍20ng/ul兩個樣品

Target size:250bp

Sonication cycles: 8 cycles (30 sec ON/90 sec OFF)

試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。廠家推薦濃度是(1-20ng/ul),在此范圍內超聲效果基本上是不變的。

 

 

 

DNA concentration:  2ng/μl

Target size:300bp

Sonication cycles: 6 cycles (30 sec ON/OFF)

試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。

 

 

 

DNA concentration:  紅2ng/μl(有誤),藍10ng/μl,綠2ng/μl,青0.2ng/μl

Target size:400bp

Sonication cycles: 6 cycles (15 sec ON/90sec OFF)

試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。濃度方面應該有誤,不影響分析,總的來說,超聲重復性理想,青0.2ng/μl濃度太低沒有檢測到。

 

  

 

DNA concentration:  紅1ng/μl,藍9ng/μl

Target size:1000bp

Sonication cycles: 8 cycles (5sec ON/90sec OFF)

試用結果:樣品品質良好,超聲效果理想。波峰明顯小于1kb,超聲循環數需要減少1-2個循環。

 

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